Hvordan lage et genetisk kart og en Associated kart

Gene kartlegging er det første skrittet i å isolere et gen. Kartet viser plasseringen av ulike gener på kromosomene som komponerer våre celler. Disse kartene er nyttige for å koble genene til de respektive steder på et kromosom, og kan bidra til å bestemme om et sjeldent arvelig lidelse er forårsaket av et bestemt gen. Gene kart er også brukt i etterforskning. Fordi Human Genome Project har utviklet et tett kartet genmarkører jevnt fordelt over menneskelig DNA samling, kan DNA-markører sammenlignes med denne informasjonen og knyttet til ulike gener. Enhver egenskap av betydning kan visualiseres ved hjelp av et gen kartet.

Bruksanvisning

1 Identifikasjon av genetiske forskjeller. Genetiske forskjeller mellom mennesker (kalt "polymorfismer") kan være så liten som en basepar. Genetiske markører er DNA-sekvenser som brukes til å identifisere individer. Under prosessen med rekombinasjon (hvor kromosomene utveksler genetisk informasjon i løpet av egg eller sædceller utvikling), gener og genetiske markører i umiddelbar nærhet har en tendens til å holde sammen og er overlevert fra mor til barn. Dette gjør det mulig å lokalisere gener for spesielle egenskaper eller sykdommer ved bruk av disse genetiske markører. Kanskje den mest pålitelige av genetiske markører er det enkelt-nukleotid polymorfisme, fordi det blir bokstavelig talt definert ved en forskjell på én basepar.

2 Acquire dataene. Bruk tilfeldig forsterket polymorf DNA (RAPD) teknikk. Denne teknikken anvender polymerase kjedereaksjon (PCR) og gelelektroforese for å bestemme gen / markør nærhet. PCR-er brukt for å lage mange kopier av et bestemt DNA-segment. Segmenter kan visualiseres ved hjelp av gelelektroforese. Plotting migrering av disse fragmentene sammen gelen mot DNA-fragmenter med kjent lengde (eller en "stige") vil tillate deg å bestemme den relative størrelsen på markør.

3 Observer genetiske forskjeller. Jo flere DNA-markører man tar med i kartet, vil mer sannsynlig en av disse markørene være knyttet til sykdomsgenet eller annet gen av betydning. For eksempel, hvis en rekke familiemedlemmer med samme sykdom arver samme genetisk markør, sjansene er sykdommen genet vil ligge nær som markør.

4 Lag visuell representasjon (assosiert kart). Bruk hyppigheten av rekombinasjon for å bestemme den genetiske avstanden mellom hver markør og skape en visuell representasjon ved hjelp av riktig programvare (se ressurser). Transforming observerte genetiske forskjeller til en meningsfull kartet krever science-spesifikke datagrafikk programvare. Pass på å riktig illustrere nærhet av genetiske markører til sine respektive gener langs kromosomet.