Hva er TPB-format?

Moderne forskere stole mer på simuleringsprogram i sin forskning. Simuleringsprogram gir dem mulighet til raskt å teste hypoteser før du går videre til selve kjemiske forsøk, som er mer tidkrevende og kostbart. En av disse simuleringsprogrammer, GROMACS, bruker TPB format.

Programmet

GROMACS er en molekylær dynamikk simuleringsprogram. Den ble utviklet av Universitetet i Groningen og ifølge Pareto Logic, kjører virus beregninger for partikkel summer, naboliste optimalisering og triclinic representasjoner for mulige permutasjoner av periodiske boks typer.

Filen

En fil med en .TPB forlengelse indikerer en binær løp inndatafilen. Den GROMACS elektroniske referanse forklarer at denne filen inneholder start strukturen i simuleringen, så vel som molekyl topologi og alle simuleringsdata på.

betraktninger

Fordi en TPB filen er i binært format, vil du ikke være i stand til å lese det med de vanlige redigeringsprogrammer. Det krever programmet gmxdump, som er inkludert i den GROMACS serien. For å lese en TPB fil, skriv "% gmxdump -s topol.tpb" (uten anførselstegn) i GROMACS. Informasjonen vil rulle raskt, imidlertid. Hvis du synes det er for vanskelig å lese, foreslår GROMACS online referanse skrive "% gmxdump -s topol.tpb | mer" (uten anførselstegn) i stedet.