Programvare for mikrobiologi

I tillegg til mikroskoper og petriskåler, datamaskiner er et viktig verktøy for mikrobiologer. Programvare for mikrobiologi forskning omfatter verktøy som brukes av andre vitenskapelige og tekniske disipliner samt spesialiserte applikasjoner for studiet av bakterier og andre mikroorganismer. Mange applikasjoner utviklet av offentlige etater, non-profit stiftelser eller akademiske forskere er tilgjengelig som gratis programvare for å laste ned og bruke som et eksperiment eller lab krever.

visualiseringsverktøy

En fysisk eller mentalt bilde av rådata du samler kan hjelpe deg å bedre forstå sin kvalitet, betydning og konsekvenser. Åpen kildekode og kommersielle data visualisering programvare er allment tilgjengelig for mikrobiologi forskning. Lag diagrammer og grafer av data ved hjelp av Libreoffice Calc, Microsofts Excel eller Mondrian datavisualiseringssystem. Cell-O og RasMol applikasjoner hjelpe deg å lage 2D og 3D-animerte modeller av biologisk viktige molekyler som proteiner og aminosyrer.

matematisk modellering

Store samlinger av mikrobiologi data ofte gir mer meningsfull informasjon når de har blitt tallmessig analysert. MATLAB, Octave og SciPy programvarepakker som utfører matematiske raffinement, analyse og modellering av forskernes data. Bruk disse pakkene for å gjøre parameter estimering gjennom kurvetilpasning, epidemiologiske spådommer, bakterievekst simuleringer og data støy eller stokastisk effekt eliminering. Disse søknaden også utføre statistiske beregninger, som variansanalyse eller khikvadrattester.

genom Bioinformatikk

Microbiology programmer også enklere å visualisere og gruve informasjon fra sekvensen av nukleinsyrer som utgjør et mikroorganismens DNA. The Open Bioinformatikk Foundation gir gratis, open-source DNA sekvensering og analyse applikasjoner som BioJava og Biopython som henter data fra genom informasjons banker, analysere en organismes DNA-kode og sammenligne den med andre DNA-prøver. Andre genomanalyse pakkene inkluderer Relieff, HMMER, Clustal Omega, Fylogeni Inference Package, eller PHYLIP, og Sequence Manipulasjon Suite eller SMS.

Referanse programvare

Den raske vitenskapelige funn i mikrobiologi og endrede statlige reguleringer gjør det essensielt at mikrobiologer har tilgang til informasjon som påvirker deres arbeid. HUGO er en kommersiell programvarepakke som gir mikrobiologer med aktuell informasjon om verktøy, kjemikalier, utstyr, dyrkingsmedier, sikkerhetskrav, nye organismer, taksonomiske endringer og antibiotika. I tillegg kan mikrobiologer jobber i matvitenskap bruke ComBase Browser web-applikasjon for å få tilgang til mat-relaterte mikrobiologiske data fra offentlige etater i Storbritannia, Australia og USA.